Запускаем его с параметром -uninstall:
uninstall_flash_player_32bit.exe -uninstall
Эта команда удалит как Flash Player ActiveX (Internet Explorer), так и плагин (для других браузеров).
Если надо удалить определенный плеер, указывается дополнительный аргумент:
-uninstall {activex | plugin}
